Données relatives aux personnes vaccinées contre la Covid-19 VAC-SI

Description

🆕24/11/2022
Publication de nouveaux indicateurs à compter de ce jour :

Couverture vaccinale du vaccin contre la COVID-19, personnes vaccinées avec trois doses de rappel (n_3_rappel, couv_3_rappel)
Couverture vaccinale du vaccin contre la COVID-19, personnes vaccinées avec un rappel adapté aux variants Omicron (n_rappel_biv, n_cum_rappel_biv, couv__rappel_biv)

Santé publique France met à jour les référentiels géographiques et de population, utilisés pour la production et la diffusion des indicateurs de suivi de l’épidémie de COVID-19. Cette actualisation sera effective le 7 juillet 2022 . Elle est amenée à être renouvelée chaque année.

MAJ 01/07/2021
Ces ressources ne sont actualisées que les jours ouvrés.

Vaccination contre la COVID-19

Dès le lancement de la campagne de vaccination, les autorités sanitaires ont disposé d’informations permettant un suivi quotidien de l’avancée et du déploiement de la campagne sur le territoire. Celles-ci, recueillies auprès des établissements pour personnes âgées et des centres de vaccination, étaient transmises par les Agences régionales de santé.

Parallèlement, l’Assurance maladie a élaboré le système d’information Vaccin Covid (VAC-SI), qui est depuis pleinement opérationnel après un travail d’analyse de l’exhaustivité et de la complétude des données.

Le système d’information Vaccin Covid est alimenté par les professionnels de santé réalisant les vaccinations.

Sur la base de l’exploitation de ces données, Santé Publique France publie en open data les indicateurs de couverture vaccinale sur data.gouv, sur Geodes ainsi que sur un dashboard disponible sur le site de santé Publique France : InfoCovidFrance

Quelles données ?

Les données issues du système d’information Vaccin Covid permettent de dénombrer en temps quasi réel (J-1), le nombre de personnes ayant reçu une injection de vaccin anti-covid en tenant compte du nombre de doses reçues, du vaccin, de l’âge, du sexe ainsi que du niveau géographique (national, régional et départemental). Les données sont disponibles par lieu de résidence.

Précaution d’usage des données

Il existe des rattrapages de saisies dans Vaccin Covid et pour un jour donné, toutes les injections n’ont pas forcément été saisies en temps réel et peuvent être saisies dans les jours suivant. Les fichiers par date permettent de rendre compte de ce rattrapage.

Dans les fichiers départementaux, si une ligne pour un nombre de vaccinés à une date donnée est absente, c’est qu’il n’y a pas eu de vacciné ce jour-là dans le département.

Les variables des différents jeux de données sont les suivantes :

jour : date de l’injection
fra, dep, reg : niveau géographique
clage_vacsi : classes d’âge
vaccin : type de vaccin
sexe : sexe
n_dose1 : Nombre de personnes ayant reçu une 1ere injection de vaccin
n_dose2 : Nombre de personnes ayant reçu une 2e injection de vaccin
n_dose3 : Nombre de personnes ayant reçu une 3e injection de vaccin
n_dose4 : Nombre de personnes ayant reçu une 4e injection de vaccin
n_complet : Nombre de personnes ayant une primo-vaccination complète. Cette information est directement fournie par la base Vaccin Covid, à l’issue d’un algorithme propre à la Cnam ou par déclaration par le professionnel de santé injecteur. Les personnes avec une primo-vaccination complète sont notamment : personnes vaccinées par deux doses par les vaccins nécessitant deux doses (ex : vaccins Pfizer, Moderna ou Astra-Zeneca), personnes vaccinées par une dose par les vaccins nécessitant une seule dose (ex : vaccin Janssen), personnes vaccinées par une dose par les vaccins Pfizer, Moderna ou Astra-Zeneca en cas d’antécédent de COVID-19, personnes immunodéprimées pouvant recevoir 3 à 4 doses.
n_rappel : Nombre de personnes avec une primo-vaccination complète ayant reçu au moins une dose avec un motif de rappel défini par le professionnel de santé vaccinateur en population générale ou spécifique
n_2_rappel : Nombre de personnes avec une primo-vaccination complète et une première dose de rappel ayant reçu une seconde dose avec un motif rappel défini par le professionnel de santé vaccinateur
n_3_rappel : Nombre de personnes avec une primo-vaccination complète et deux doses de rappel ayant reçu une troisième dose avec un motif rappel défini par le professionnel de santé vaccinateur
n_rappel_biv : Nombre de personnes vaccinées avec rappel adapté aux variants Omicron.
n_cum_dose1 : Nombre cumulé de personnes ayant reçu 1 injection de vaccin
n_cum_dose2 : Nombre cumulé de personnes ayant reçu 2 injections de vaccin
n_cum_dose3 : Nombre cumulé de personnes ayant reçu 3 injections de vaccin
n_cum_dose4 : Nombre cumulé de personnes ayant reçu 4 injections de vaccin
n_cum_complet : Nombre cumulé de personnes ayant une primovaccination complète schéma vaccinal complet. Cette information est directement fournie par la base Vaccin Covid, à l’issue d’un algorithme propre à la Cnam ou par déclaration par le professionnel de santé injecteur. Les personnes avec une primo-vaccination complète sont notamment : personnes vaccinées par deux doses par les vaccins nécessitant deux doses (ex : vaccins Pfizer, Moderna ou Astra-Zeneca), personnes vaccinées par une dose par les vaccins nécessitant une seule dose (ex : vaccin Janssen), personnes vaccinées par une dose par les vaccins Pfizer, Moderna ou Astra-Zeneca en cas d’antécédent de COVID-19, personnes immunodéprimées pouvant recevoir 3 à 4 doses.
n_cum_rappel : Nombre cumulé de personnes avec une primo-vaccination complète ayant reçu au moins une dose avec un motif de rappel défini par le professionnel de santé vaccinateur en population générale ou spécifique
n_cum_rappel_biv : Nombre cumulé de personnes vaccinées avec rappel adapté aux variants Omicron.
couv_dose1 : Couverture vaccinale dans la population de la première dose de vaccin contre la COVID-19 (= couverture vaccinale au moins une dose = n_cum_dose1/pop).
couv_complet : Couverture vaccinale dans la population de la primovaccination complète du vaccin contre la COVID-19 (ie nombre de personnes complètement primovaccinées / population = n_cum_complet/pop). Les personnes avec une primo-vaccination complète sont notamment : personnes vaccinées par deux doses par les vaccins nécessitant deux doses (ex : vaccins Pfizer, Moderna ou Astra-Zeneca), personnes vaccinées par une dose par les vaccins nécessitant une seule dose (ex : vaccin Janssen), personnes vaccinées par une dose par les vaccins Pfizer, Moderna ou Astra-Zeneca en cas d’antécédent de COVID-19, personnes immunodéprimées pouvant recevoir 3 à 4 doses.
couv_rappel : Couverture vaccinale dans la population du 1er rappel du vaccin contre la COVID-19, (ie couverture primo-vaccination COVID19 complète et avec une dose de rappel = n_cum_rappel/pop)
couv_2_rappel : Couverture vaccinale dans la population du second rappel du vaccin contre la COVID-19, (ie couverture primo-vaccination COVID19 complète et deux doses de rappel = n_cum_2_ rappel/pop)
couv_3_rappel : Couverture vaccinale dans la population du troisième rappel du vaccin contre la COVID-19
couv__rappel_biv : Couverture vaccinale du vaccin contre la COVID-19, personnes vaccinées avec un rappel adapté aux variants Omicron

La population de référence utilisée est issue de l’Insee : Estimations localisées de population, données Insee du 1er janvier 2020 pour les données de 2020, données Insee du 1er janvier 2021 pour les données de 2021, données Insee du 1er janvier 2022 pour les données de 2022.

Les classes d'âge utilisées sont les suivantes :

0 : Tous âges
04 : 0-4
09 : 5-9
11 : 10-11
17 : 12-17
24 : 18-24
29 : 25-29
39 : 30-39
49 : 40-49
59 : 50-59
64 : 60-64
69 : 65-69
74 : 70-74
79 : 75-79
80 : 80 et +

Le sexe est codifié de la façon suivante :

0 : hommes + femmes + Non renseigné
1 : homme
2 : femme

La région (colonne « reg ») suit la codification du Code Officiel Géographique de l’INSEE, elle est codifiée de la manière suivante :

01 : Guadeloupe
02 : Martinique
03 : Guyane
04 : La Réunion
11 : Ile-de-France
24 : Centre-Val de Loire
27 : Bourgogne-Franche-Comté
28 : Normandie
32 : Hauts-de-France
44 : Grand Est
52 : Pays de la Loire
53 : Bretagne
75 : Nouvelle-Aquitaine
76 : Occitanie
84 : Auvergne-Rhône-Alpes
93 : Provence-Alpes-Côte d’Azur
94 : Corse
05 : Saint-Pierre-et-Miquelon
06 : Mayotte
07 : Saint-Barthélemy
08 : Saint-Martin

Les vaccins sont codifiés de la façon suivante :

0 : Tous vaccins
1 : COMIRNATY-30-adulte (Pfizer/BioNTech)
2 : Spikevax (Moderna)
3 : Vaxzevria (AstraZeneca)
4 : Janssen (Johnson&Johnson)
5 : COMIRNATY-10-enfant (Pfizer/BioNTech)
6 : NUVAXOVID (Novavax)
9 : Spikevax Bivalent (Moderna)
10 : Sanofi VidPrevtyn Beta
11 : COMIRNATY-3 pédiatrique 6 m-4a (Pfizer/BioNTech)
12 : Spikevax Bivalent Ori/Omi BA.5 (Moderna)

Un certain nombre de ressources sont disponibles sur ce jeu de données. Il est listé ci-dessous le contenu de chacun d’entre eux :

Données globales

Fichiers avec le nombre de personnes ayant reçu au moins une dose, 2 doses, 3 doses, 4 doses, une dose de rappel ou complètement vaccinées, arrêté à la dernière date disponible :

vacsi-tot-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
vacsi-tot-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
vacsi-tot-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale)

Fichiers avec le nombre quotidien de personnes ayant reçu au moins une dose, 2 doses, 3 doses, 4 doses, une dose de rappel ou par date d’injection :

vacsi-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
vacsi-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
vacsi-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale).

Données par âge et sexe

Fichiers avec la couverture vaccinale et le nombre (journalier et cumulé) de personnes ayant reçu au moins une dose, une dose de rappel, une deuxième dose de rappel ou complètement vaccinées, par sexe (Hommes = _h ; Femmes = _f ; Tous sexes confondus = _e) et par classes d’âge, arrêté à la dernière date disponible :

vacsi-s-a-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
vacsi-s-a-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
vacsi-s-a-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale)

Données par sexe

Fichiers avec le nombre de personnes ayant reçu au moins une dose, 2 doses, 3 doses, 4 doses, une dose de rappel ou complètement vaccinées, par sexe, arrêté à la dernière date disponible :

vacsi-tot-s-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
vacsi-tot-s-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
vacsi-tot-s-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale)

Fichiers avec le nombre quotidien de personnes ayant reçu au moins une dose, 2 doses, 3 doses, 4 doses, une dose de rappel ou complétement vaccinés par sexe, et par date d’injection :

vacsi-s-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
vacsi-s-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
vacsi-s-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale).

Données par classes d'âge

Fichiers avec le nombre de personnes ayant reçu au moins une dose, 2 doses, 3 doses, 4 doses, une dose de rappel ou complètement vaccinées, par classes d’âge, arrêté à la dernière date disponible :

vacsi-tot-a-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
vacsi-tot-a-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
vacsi-tot-a-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale)

Fichiers avec le nombre de personnes ayant reçu au moins une dose, 2 doses, 3 doses, 4 doses, une dose de rappel ou complètement vaccinées, par classes d’âge, et par date d’injection :

vacsi-a-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
vacsi-a-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
vacsi-a-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale).

Données par vaccin

Fichiers avec le nombre de personnes ayant reçu au moins une dose, ou deux doses, ou trois doses par vaccin, arrêté à la dernière date disponible :

vacsi-tot-v-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
vacsi-tot-v-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
vacsi-tot-v-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale)

Fichiers avec le nombre quotidien de personnes ayant reçu au moins une dose, 2 doses, 3 doses ou 4 doses par vaccin, et par date d’injection :

vacsi-v-fra-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle nationale)
vacsi-v-reg-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle régionale)
vacsi-v-dep-YYYY-MM-DD-HHhmm.csv (échelle départementale).

Remarques :

Des troisièmes doses de vaccin sont saisies dans vaccin COVID à une date antérieure à la recommandation de vaccination des personnes immunodéprimées. II ne peut être déterminé si les données ainsi saisies correspondent à des erreurs de saisie ou à de véritables injections de vaccin en troisième dose.
L’analyse des données issues de vaccin COVID rapporte des seconde ou troisième doses de vaccin comme ayant été réalisées avec un vaccin Janssen. Pour les personnes concernées, le vaccin administré en première dose était un vaccin autre que Janssen (AstraZeneca, Pfizer ou Moderna). Le vaccin Janssen est un vaccin monodose. Il ne peut être déterminé si les données ainsi saisies correspondent à des erreurs de saisie ou à de véritables injections de vaccin Janssen en seconde dose.
Les vaccinations observées chez les enfants de moins de 5 ans correspondent probablement à des enfants à très haut risque de forme grave de COVID. Il ne peut cependant être exclu des erreurs de saisies sur certains dossiers.

Santé publique France ne réalise aucun retraitement de données issues de la base Vaccin Covid : les informations disponibles dans la base ne permettent pas de connaitre les différentes situations personnelles des personnes recevant des injections, ni les raisons de ces dernières (personnes immunodéprimées, personnes ayant eu la covid…).

Producer: Santé publique France
License: Licence Ouverte / Open Licence version 2.0
Last update: July 13, 2023

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110 discussions

Vaccin bivalent

Yann Roque

—

Posted the November 26, 2022

Dans les définitions de metadata vous écrivez : "n_rappel_biv : Nombre de personnes vaccinées avec rappel adapté aux variants Omicron." Compte-tenu de la date d'apparition de cette nouvelle version du vaccin sous-entend que cette dose est le 3ème rappel. Donc le cumul "n_cum_3_rappel" inclus le cumul "n_cum_rappel_biv" Or les chiffres sont les suivants (population totale) : "n_cum_rappel_biv" = 1664805 "n_cum_3_rappel" = 479994 Ce qui montre que cum_3 n'inclus pas les rappels bivalents Donc vous passez d'une logique chronologique (dose 1, dose 2, ..., dose n) à une logique par produit Comment voulez-vous que l'on travaille correctement sur le sujet ? je suggère : - soit que vous rebaptisiez "n_cum_rappel_biv" en ""n_cum_rappel_biv3" (ce qui facilitera le suivi lorsqu'on en sera à la dose 19 !) - soit que vous fassiez disparaître cette notion de bivalent pour qu'elle soit simplement suivie dans le tableau par "produit" comme vous l'avez commencé avec "9 : Spikevax Bivalent (Moderna)" et " COMIRNATRY-10-enfant (Pfizer/BioNTech)" Merci de considérer cette proposition PS: au passage merci de corriger dans tous vos textes COMIRNARTY en COMIRNATY

Erreur couverture dose de rappel

Raphael MARTIN

—

Posted the November 8, 2022

Sur la classe d'âge 75-79 ans, la couverture de la dose de rappel passe de 77.5 à 70.1 entre le 31 décembre 2021 et le 1er janvier 2022. Il doit s'agir d'une erreur (la couverture ne pouvant naturellement pas baisser).

Données par vaccin ?

Pierrick THEVENON

—

Posted the June 13, 2022

Bonjour, J'ai essayé de comprendre plusieurs de vos fichiers. Cependant, les fichiers correspondant aux données par vaccin "vacsi-v-fra-" ne sont pas clairs, et nous ne retrouvons que partiellement des chiffres qui corrèlent avec vos données globales. Notamment, pouvez-vous nous préciser, dans ce fichier ce que vous comptabilisez dans : - n_tot_dose1 - n_tot_dose2 - n_tot_dose3 - n_tot_dose4 - n_tot_rappel Qu'appelez-vous doses 3, 4 et rappel ? Il est difficile de faire la corrélation avec les autres fichiers de données globales qui évoquent notamment le 2ème rappel, qui distinguent les schémas complets, etc. Je vous remercie par avance.

Pierrick THEVENON

—

Posted the June 21, 2022

Bonjour, Est-il possible d'avoir une réponse svp ?

Toujours des erreurs dans les fichiers depuis 4ème dose

Yann Roque

—

Posted the May 1, 2022

Pour le stagiaire de CM2 qui réalise ces fichiers : - les nb de 4ème dose ont bien été convertis de décimal en entier .... merci - en revanche pas de total toutes classes d'âge (classe 0) des 4ème doses par jour - pas de cumul toutes classes d'âge (classe 0) des 4ème doses Un peu fatiguant de devoir le répéter et surtout de le faire soi-même tous les jours